Năm 2016, toàn ngành NN&PTNT đã nghiêm túc triển khai thực hiện các chủ trương, chỉ đạo của Đảng, Chính phủ; bám sát tình hình thực tiễn; phối hợp chặt chẽ với các Bộ, ngành, địa phương triển khai toàn diện các nhiệm vụ được giao và đạt được nhiều kết quả. Tái cơ cấu tiếp tục được triển khai tích cực trên tất cả các lĩnh vực; kiểm soát tốt dịch bệnh trên cây trồng, vật nuôi; theo dõi sát sao và đối phó có hiệu quả với các diễn biến bất thường của thời tiết, đặc biệt là hạn hán ở các tỉnh miền trung và Tây Nguyên, xâm nhập mặn ở các tỉnh Đồng bằng sông Cửu Long, lũ lụt ở Nam Trung Bộ; thực hiện tốt công tác phòng chống cháy rừng. Công tác kiểm soát an toàn vệ sinh thực phẩm các mặt hàng nông, lâm, thủy sản tiếp tục được chỉ đạo triển khai mạnh mẽ đã tạo được chuyển biến tích cực, bước đầu kiểm soát được tình hình buôn bán và sử dụng chất cấm trong sản xuất. Theo báo cáo, tốc độ tăng GDP toàn ngành năm 2016 đạt khoảng 1,2%; giá trị sản xuất (theo giá so sánh năm 2010) tăng 1,44%. Trong đó, trồng trọt giảm 0,9%, chăn nuôi tăng 5,4%, lâm nghiệp tăng 6,17%, thủy sản tăng 2,91%.
Chương trình mục tiêu Quốc gia nông thôn mới đạt được kế hoạch đề ra. Đến nay cả nước có 2.235 xã đạt chuẩn NTM, chiếm 25,07%. Chương trình chú trọng hơn đến phát triển sản xuất và đầu tư các cơ sở hạ tầng thiết yếu trên địa bàn xã (giao thông, điện, nước sạch, trường học các cấp, trạm y tế xã, nhà văn hóa và khu thể thao thôn), đặc biệt là đối với những xã nghèo, xã đặc biệt khó khăn, tạo điều kiện thuận lợi cho phát triển kinh tế - xã hội và tăng hưởng thụ trực tiếp cho cư dân nông thôn.
Bên cạnh những kết quả đạt được, toàn ngành vẫn còn tồn tại những hạn chế, yếu kém như: tăng trưởng ngành mặc dù được phục hồi nhưng ở mức thấp và chưa đạt kế hoạch đề ra; triển khai tái cơ cấu ngành chưa đồng đều. Kết quả xây dựng NTM chưa đồng bộ, đời sống của một bộ phận nông dân còn gặp khó khăn; mức độ thực hiện ở các địa phương miền núi phía Bắc, Tây Nguyên đạt thấp; nợ xây dựng cơ bản trong xây dựng NTM ở nhiều địa phương chưa được giải quyết. Đổi mới sản xuất còn chậm; hiệu quả các hình thức tổ chức sản xuất chưa được đánh giá tổng kết và nhân rộng. Cơ sở hạ tầng nông nghiệp nông thôn còn nhiều bất cập; đổi mới và phát triển các hình thức tổ chức sản xuất còn chậm; thu hút đầu tư tư nhân, nước ngoài và các nguồn lực xã hội vào việc tái cơ cấu còn hạn chế; hệ thống quản lý nhà nước từ Trung ương đến địa phương cơ sở chưa đồng bộ.
Tại hội nghị, Thủ tướng Chính phủ Nguyễn Xuân Phúc đánh giá cao và biểu dương sự cố gắng khắc phục khó khăn của ngành Nông nghiệp để có kết quả tăng trưởng như báo cáo. Tuy vậy, Thủ tướng cũng khẳng định, ngành Nông nghiệp còn nhiều hạn chế cần khắc phục. Trong đó, nhấn mạnh một số giải pháp để sớm khắc phục sớm thiên tai, đặc biệt ngành cần chú trọng đến khắc phục cơ sở hạ tầng tại các tỉnh thiệt hại nặng nề trong đợt mưa lũ vừa qua; quan tâm và lo tết cho người dân vùng thiên tai, không để người dân lâm vào cảnh “đứt bữa đói cơm”, chú trọng phát triển mạnh công nghệ chế biến; tiếp tục khai thác hội nhập quốc tế trong ngành sâu rộng hơn; đảm bảo đời sống cho người dân bằng việc tiếp tục đẩy mạnh công cuộc xây dựng NTM. Bên cạnh đó, tiếp tục thực hiện tái cơ cấu ngành nông nghiệp, chú ý “không tái cơ cấu trên giấy, không tái cơ cấu nửa vời”, phấn đấu hoàn thành nhiệm vụ và chỉ tiêu kế hoạch ngành đề ra trong năm 2017.
