Năm 2015, Thanh tra Sở NN&PTNT các tỉnh phía Bắc đã đạt được những kết quả đáng kể trong công tác thanh tra chuyên ngành. Cụ thể: Tiến hành thanh tra, kiểm tra hàng nghìn tổ chức, cá nhân hoạt động trong lĩnh vực nông nghiệp. Theo số liệu tổng hợp sau đợt cao điểm kiểm tra tại 35 tỉnh, thành phố, vi phạm về ATTP có dấu hiệu giảm dần. Các địa phương đã tổ chức hơn 1.400 hội nghị, hội thảo, tập huấn tuyên truyền về đảm bảo an toàn thực phẩm cho hơn 35.000 người sản xuất, kinh doanh. Hướng dẫn hơn 2.780 cơ sở áp dụng tiêu chuẩn VietGAP và đã có 2.225 cơ sở được chứng nhân áp dụng VietGAP, đạt 80%; hỗ trợ xây dựng được 280 chuỗi cung ứng nông thủy sản an toàn; cấp gần 20.000 tem sản phẩm an toàn cho các sản phẩm được xác nhận... Tỷ lệ mẫu giám sát tồn dư thuốc bảo vệ thực vật trong rau đã giảm 48%; tồn dư hóa chất, kháng sinh trong sản phẩm thịt đã giảm 73%; ô nhiễm vi sinh trong thịt giảm 4%... Qua thanh tra, kiểm tra chuyên ngành đã phát hiện và xử lý nhiều trường hợp vi phạm. Đồng thời đề xuất, kiến nghị với các cơ quan có thẩm quyền sử đổi, bổ sung quy định, quy chế nhất là các văn bản quy phạm pháp luật về xử phạt vi phạm hành chính trong sản xuất, kinh doanh, sử dụng vật tư nông nghiệp; vệ sinh an toàn thực phẩm để khắc phục những bất cập trong công tác quản lý.
Năm 2016, Thanh tra Sở NN&PTNT các tỉnh phía Bắc tập trung xây dựng kế hoạch thanh tra chuyên ngành và triển khai các cuộc thanh tra, kiểm tra vệ sinh ATTP; thanh tra việc chấp hành pháp luật chuyên ngành, quy định về chuyên môn - kỹ thuật trong hoạt động sản xuất, kinh doanh vật tư nông nghiệp. Tiếp tục đổi mới phương pháp, cách thức chỉ đạo điều hành trong hoạt động thanh tra, kiểm tra. Tiếp tục phối hợp chặt chẽ với các ban, ngành của tỉnh, thành phố trong hoạt động thanh tra, kiểm tra. Tăng cường công tác đào tạo, bồi dưỡng nâng cao trình độ đội ngũ cán bộ, công chức làm công tác thanh tra. Làm tốt công tác tuyên truyền, phổ biến giáo dục pháp luật.