Khi sử dụng Chữ kí số, con người được giải phóng khỏi việc sử dụng một khối lượng lớn giấy tờ và các loại "Vật mang tin truyền thống" khác gây khó khăn đặc thù như: Việc phải in ra giấy, nhân bản hay tiêu hủy và những tác động xấu đến con người, môi trường... đều được làm dễ đi, hiệu quả hơn rất nhiều khi chuyển sang môi trường "Vật mang điện tử".
Những người có nhu cầu tương tác các văn bản, tài liệu điện tử không cần phải rời khỏi công sở hoặc gia đình mình mà vẫn thực hiện được thông qua hệ thống máy tính và các phương tiện truyền thông, Viễn thông kết nối bởi mạng Internet.
Các văn bản, tài liệu điện tử được xử lý tự động sẽ khách quan minh bạch, ít sai sót hơn khi không có sự can thiệp trực tiếp của con người vào quá trình xử lý. Các dịch vụ chứng thực số giúp chúng ta ngăn chặn không để cho những sự can thiệp sửa đổi trái phép vào nội dung các tài liệu, văn bản điện tử mà lại không bị phát hiện.
Năng suất xử lý các tài liệu, văn bản điện tử sẽ tăng lên gấp nhiều lần so với xử lý theo phương pháp thủ công truyền thống, giải phóng cho con người được nhiều sức lao động, dành thêm thời gian cho các hoạt động xã hội góp phần nâng cao đời sống vật chất và tinh thần cho người lao động.
Khi xử lý trên các phương tiện điện tử tính chính xác sẽ rất cao tránh nhiều rủi ro nhầm lẫn như xử lý thủ công của con người như trên thực tế đã cho thấy đã có rất nhiều nhầm lẫn cơ học trong việc xử lý tài liệu, văn bản truyền thống.
Thực hiện Chữ ký số, khả năng dự phòng sẽ tăng cao của các tài liệu, văn bản điện tử so với các tài liệu, văn bản truyền thống bời việc dự phòng các tài liệu, văn bản điện tử sẽ thuận tiện hơn nhiều vì có thể nhân bản dễ dàng và lưu trữ an toàn tại nhiều nơi cách xa nhau và có thể nhanh chóng được phục hồi tại bất kỳ đâu.
Về mức độ an toàn sẽ cao hơn khi sử dụng các hạ tầng khóa công khai PKI (Các hạ tầng khóa công khai PKI được pháp luật thừa nhận sẽ đảm nhiệm việc duy trì các Chứng thư số cho các thuê bao làm công cụ để sinh ra và kiểm tra hợp lệ các Chữ ký số), cấp phát và duy trì các Chứng thư số với các dịch vụ chứng thực điện tử. Đây là giải pháp an toàn được cho là cao nhất trong các giải pháp an toàn phù hợp sử dụng mật mã hiện nay trên thế giới.
Hiệu quả thực tế ứng dụng Chữ ký số đối với hoạt động quản lý của các cơ quan nhà nước sẽ mang lại nhiều lợi ích như: Tăng năng xuất xử lý công việc, giảm thời gian và chi phí dành cho các công việc liên quan đến văn bản giấy (in ấn, phát hành, lưu trữ...) và nâng cao mức độ an toàn và bảo mật cho các giao dịch điện tử giữa các cơ quan hành chính nhà nước trên môi trường mạng Internet và máy tính.
