Bộ tiêu chí này được áp dụng để đánh giá các hoạt động bảo vệ, chăm sóc và nâng cao sức khỏe nhân dân của toàn xã, phường, thị trấn (sau đây gọi là xã), chứ không chỉ đánh giá hoạt động của trạm Y tế xã. Xã được công nhận đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế xã nếu đáp ứng đầy đủ các yêu cầu sau: Đạt từ 80% tổng điểm trở lên; Số điểm trong mỗi tiêu chí phải đạt từ 50% số điểm của tiêu chí đó trở lên; Không bị liệt điểm; Các tiêu chí đánh giá dựa theo các quy định hiện hành. Khi các quy định đó thay đổi thì tiêu chí đánh giá cũng cần thay đổi theo cho phù hợp; Việc đánh giá thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã được thực hiện hằng năm. Xã được công nhân đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế có thời hạn trong vòng 3 năm. Nếu các năm tiếp không đạt Bộ tiêu chí thì phải rút danh hiệu đã công nhận.
Tuyến tỉnh: Ban chỉ đạo Chăm sóc sức khoẻ nhân dân tỉnh chỉ đạo việc thực hiện Bộ tiêu chí. Sở Y tế là cơ quan đầu mối phối hợp với các đơn vị liên quan hướng dẫn, chỉ đạo thực hiện, theo dõi, đánh giá kết quả thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về y tế xã giai đoạn đến 2030 cho các huyện, thị xã, thành phố.
Tuyến huyện: Ban chỉ đạo Chăm sóc sức khoẻ nhân dân cấp huyện chỉ đạo việc thực hiện Bộ tiêu chí. Phòng Y tế thành phố và Văn phòng HĐND- UBND các huyện là cơ quan đầu mối tham mưu giúp UBND cấp huyện chỉ đạo Trung tâm Y tế phối hợp với các đơn vị liên quan khác hướng dẫn thực hiện, theo dõi, đánh giá tình hình thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã cho các xã trong huyện.
Tuyến xã: Ban chỉ đạo Chăm sóc sức khoẻ nhân dân cấp xã chỉ đạo thực hiện. Trạm Y tế xã làm đầu mối phối hợp với các đơn vị có liên quan triển khai thực hiện các hoạt động phấn đấu thực hiện các chỉ tiêu trong Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã dưới sự hướng dẫn của Y tế tuyến trên.
Các nội dung triển khai thực hiện cụ thể như sau:
Tuyến tỉnh: Ban chỉ đạo Chăm sóc sức khoẻ nhân dân tỉnh (đơn vị thường trực là Sở Y tế) chịu trách nhiệm theo dõi và giám sát định kỳ các hoạt động và các chỉ tiêu đạt được trong Bộ Tiêu chí quốc gia về Y tế xã hằng quý của tỉnh. Hỗ trợ cấp huyện tháo gỡ các khó khăn trong quá trình thực hiện; gửi báo cáo về Bộ Y tế. Phổ biến nội dung Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã đến các đơn vị trực thuộc, Phòng Y tế cấp huyện và các đơn vị liên quan thông qua các hội nghị giao ban của ngành và trên Website của Sở Y tế.
Tuỳ thuộc vào tình hình thực tế của từng địa phương như khoảng cách địa lý, địa hình, nhu cầu chăm sóc sức khoẻ nhân dân, Sở Y tế chịu trách nhiệm rà soát, phân loại và lập danh sách các xã của từng vùng cho phù hợp. Tham mưu cho UBND tỉnh ban hành Kế hoạch thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã giai đoạn đến năm 2030 trên địa bàn tỉnh Hòa Bình. Hướng dẫn Y tế tuyến huyện xây dựng và triển khai kế hoạch thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã nhằm đạt mục tiêu tỷ lệ các xã được công nhận đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế xã theo từng giai đoạn.
Tuyến huyện: Ban chỉ đạo Chăm sóc sức khoẻ nhân dân cấp huyện, cùng với Phòng Y tế thành phố và Trung tâm y tế chịu trách nhiệm theo dõi, giám sát định kỳ và đột xuất trong việc thực hiện các chỉ tiêu trong Bộ Tiêu chí quốc gia về Y tế tại các xã. Trực tiếp thực hiện một số hoạt động trong Bộ Tiêu chí quốc gia về Y tế xã theo sự phân công của Sở Y tế. Trung tâm Y tế tuyến huyện và các đơn vị liên quan phổ biến nội dung Bộ Tiêu chí quốc gia về Y tế xã đến các xã trên địa bàn. Đánh giá thực trạng tình hình y tế xã hiện nay so với Bộ Tiêu chí quốc gia về Y tế xã giai đoạn đến năm 2030. Hướng dẫn các xã, phường, thị trấn xây dựng kế hoạch thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã. Xây dựng Kế hoạch cụ thể để triển khai thực hiện các hoạt động nhằm đạt chỉ tiêu số xã được công nhận đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế xã.
Tuyến xã: Báo cáo kịp thời, chính xác thực trạng và kết quả đạt được trong việc triển khai thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã theo hướng dẫn của Y tế tuyến trên. Quán triệt các nội dung của Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã. Tự đánh giá, so sánh thực trạng hiện nay với Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã. Xây dựng kế hoạch, giải pháp và triển khai thực hiện các hoạt động nhằm thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã theo hướng dẫn của tuyến trên; trình UBND cấp xã phê duyệt. Đăng ký xã phấn đấu đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế với cơ quan quản lý cấp huyện (Trung tâm Y tế, Phòng Y tế, Văn phòng HĐND-UBND) và những kiến nghị cần thiết đề nghị tuyến trên hỗ trợ.
Thời gian được xác định để kiểm tra, đánh giá việc thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã của một năm là 12 tháng (tính từ ngày 01/11 của năm trước đến hết ngày 30/10 của năm kiểm tra, đánh giá). Trước ngày 20/10 hàng năm, trạm Y tế các xã, phường, thị trấn (gọi chung là xã) tham mưu cho UBND xã có văn bản gửi Phòng Y tế cấp huyện để đăng ký phấn đấu đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế xã trong năm sau. Trong tháng 11 hàng năm, Phòng Y tế cấp huyện tổng hợp, báo cáo Ban Chỉ đạo Bảo vệ và Chăm sóc sức khỏe nhân dân cấp huyện và có văn bản gửi Sở Y tế để đăng ký các xã phấn đấu đạt Tiêu chí quốc gia về y tế xã của huyện trong năm sau.
Bộ hồ sơ đăng ký bao gồm: Văn bản đăng ký các xã đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế xã của cấp huyện; Kế hoạch thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về y tế xã của năm do UBND cấp huyện phê duyệt; Biên bản chấm điểm chi tiết theo 10 tiêu chí quốc gia về Y tế của xã trong năm của UBND cấp huyện. Văn bản đăng ký xã đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế của cấp xã; Kế hoạch thực hiện Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã của UBND cấp xã; Bảng chấm điểm chi tiết theo 10 tiêu chí quốc gia về Y tế của UBND cấp xã. Hồ sơ đăng ký gửi về Sở Y tế (qua Phòng Nghiệp vụ Y).
Đối với các xã đề nghị công nhận lần đầu (xã mới): Tuyến xã: Trạm Y tế tự tổ chức đánh giá việc đạt các tiêu chí theo bảng chấm điểm của Bộ tiêu chí quốc gia về Y tế xã quy định tại Quyết định số 1300 của Bộ Y tế; thu thập đầy đủ các tài liệu, số liệu, hồ sơ để chứng minh cho việc đạt các tiêu chí. Sau khi trạm y tế tự đánh giá đã đạt các tiêu chí theo quy định, trạm Y tế báo cáo UBND cấp xã, có Công văn của UBND xã kèm hồ sơ liên quan gửi cơ quan quản lý Nhà nước cấp huyện (Phòng Y tế, Văn phòng HĐND-UBND), đề nghị xét công nhận xã đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế. Thời gian: Trước ngày 20 tháng 10 hàng năm.
Đối với các xã đạt Tiêu chí quốc gia về Y tế sau 3 năm được công nhận: Xã được công nhận đạt Tiêu chí quốc gia về y tế có thời hạn trong vòng 3 năm. Sau 3 năm các xã lập hồ sơ đề nghị thẩm định và đề nghị công nhận lại. Trình tự đánh giá như xã xét công nhận đạt Tiêu chí quốc gia về y tế xã lần đầu.