Hiện nay trên địa bàn tỉnh có 93 chợ, 2 trung tâm thương mại, 3 siêu thị. Tuy nhiên trong 93 chợ có 65 chợ bán kiên cố, 22 chợ tạm nên ảnh hưởng không nhỏ đến phát triển kinh tế tại địa phương. Hiện đang triển khai đề án xây dựng mô hình chợ thí điểm bảo đảm an toàn thực phẩm tại chợ Thái Bình với tổng kinh phí thực hiện 350 triệu đồng.
Nhìn chung chợ trên địa bàn tỉnh vẫn chủ yếu ở dạng lán tạm, chợ cóc và họp chợ tùy tiện trên các nền đất trống, gây ảnh hưởng tới giao thông. Bên cạnh đó điều kiện vệ sinh môi trường, hệ thống xử lý nước thải chưa có, gây mất vệ sinh an toàn thực phẩm. Công tác quản lý chợ cũng gặp khó khăn, tình trạng các chợ cóc dẹp lại “mọc” đã xảy ra từ nhiều năm nay xong vẫn chưa tìm được câu trả lời thích đáng.